มหาวิทยาลัยแม่ฟ้าหลวงได้ตระหนักถึงความสำคัญของชาและกาแฟ ซึ่งเป็นพืชเศรษฐกิจสำคัญของจังหวัดเชียงราย โดยได้จัดตั้งองค์กรเฉพาะกิจ "สถาบันชาและกาแฟ" แห่งมหาวิทยาลัยแม่ฟ้าหลวง (Tea and Coffee Institute of Mae Fah Luang University) เพื่อเป็นศูนย์กลางองค์ความรู้และถ่ายทอดเทคโนโลยีด้านชาและกาแฟโดยเฉพาะ